Kolistinresistens

Helgenomsekvensering och SNP-analys för epidemiologisk typning för påvisning av mcr-gen, vilken är plasmidburen och kan ge upphov till kolistinresistens.

Analystyp
Indikation	Vid genetisk verifiering av resistensgen hos isolat med resistens mot kolistin.
Provmaterial	Bakterieisolat i transportmedium.
Provtagningsanvisningar	Ange på remissen från vilket provmaterial isolatet isolerats, provtagningsdatum och övriga uppgifter av betydelse. Om telefonsvar önskas anges telefonnummer och kontaktperson på remissen.
Transport
Svarstid	Inom 5 till 10 dagar.
Ackrediterad	Nej.
Anmälningspliktig enligt SML	Nej.
Avgiftsbelagd	Se prislista
Övrig info	Avgiftsfri inom ramen för det nationella mikrobiella övervakningsprogrammet. Mer om Mikrobiella och immunologiska övervakningsprogram. Genotypisk detektion av resistensgen för kolistinresistens utförs med helgenomsekvensering. Epidemiologisk typning: SNP-analys Resultaten svaras ut i pappersform till insändande laboratorium. Svaret anger vilka analyser som utförts samt resultaten av de utförda analyserna. Provsvaret innehåller även en tolkning av resultaten. För fenotypisk resistens skickas isolatet till referenslaboratoriet i Växjö.