Influensa – Mikrobiellt övervakningsprogram
Influensa ingår i vårt mikrobiella övervakningsprogram. Här finns kort information om programmets syfte, omfattning och metodik.
Syfte
Övervakning sker för att kunna informera sjukvård, myndigheter och allmänhet om förekomst och spridning av influensa i Sverige och därmed bidra till att ge bättre förutsättningar för planering och klinisk handläggning. Övervakningen syftar till att följa vilka influensastammar som cirkulerar i landet, om de liknar vaccinstammarna och om antivirala medel är effektiva, samt till att upptäcka eventuell fågelinfluensa eller annan zoonotisk influensa. Detta åstadkoms genom typning med molekylära metoder som typnings-PCR och sekvensering samt virusisolering av ett urval prover. Fågelinfluensa eller annan zoonotisk influensa upptäcks genom vidare karaktärisering av influensa A-positiva prover som ger negativt resultat för cirkulerande säsongsinfluensa, subtyp A(H1)pdm09 och A(H3), eller som uppvisar andra avvikande metodologiska resultat. Utöver det har Folkhälsomyndigheten en pandemiberedskap och omvärldsbevakning för att etablera diagnostik för influensa med pandemisk potential.
Genom den nationella virologiska influensaövervakningen bidrar Sverige tillsammans med många andra europiska länder och globalt också till underlag gällande valet av stammar som ska ingå i nästa säsongs influensavaccin.
Omfattning
Den nationella virologiska övervakningen av influensa på Folkhälsomyndigheten består av sentinelprover från primärvården samt prover från sjukhusens kliniska mikrobiologiska laboratorier, framförallt från sjukhusvårdade patienter. Övervakningen bedrivs året runt, men den formella säsongen inklusive för sentinelövervakningen omfattar perioden från vecka 40 på hösten till och med vecka 20 på våren. Sentinelprovtagning innebär att deltagande vårdcentraler, varje vecka tar näsprover från patienter med influensaliknande sjukdom (ILI, ARI) och skickar in dem till Folkhälsomyndigheten för analys. För den virologiska övervakningen ombeds de kliniska mikrobiologiska laboratorierna att skicka in ett urval av influensapositiva prover.
Insamlingen av influensapositiva prover från kliniska mikrobiologiska laboratorier är uppdelad i två delar. En riktad insamling, som gäller alla laboratorier, samt en löpande insamling, som gäller ett fåtal utvalda laboratorier. Se kriterier nedan. Den löpande övervakningen kompletterar den riktade insamlingen under perioden från vecka 40 på hösten till och med vecka 20 på våren.
Kriterier för den riktade insamlingen av prover inom övervakningen för alla kliniska mikrobiologiska laboratorier året runt
- Prover positiva för influensa A/B från patienter där laboratoriet har kännedom om svår sjukdom och/eller ovanlig sjukdomsbild (till exempel IVA-vårdade, CNS-engagemang) och patienter med vaccinationsgenombrott.
- Prover där laboratoriet har kännedom om att de ingår i ett utbrott inom sjukvård och särskilda boenden (om subtypning inte görs på det lokala laboratoriet).
- Prover positiva för influensa A med ct-värde <33 som vid lokal subtypnings-PCR blir otypbara/negativa gentemot A(H1)pdm09 eller A(H3).
Skicka starka prover (ct-värde < 33) med minst 500 μL provmaterial utifrån ovan ställda kriterier om detta är möjligt.
Kriterier för den löpande övervakningen som gäller utvalda kliniska mikrobiologiska laboratorier, mellan vecka 40 och vecka 20
- Totalt upp till fem prover positiva för influensa A/B per vecka, löpande under säsongen inom det nationella mikrobiologiska övervakningsprogrammet för influensa.
Skicka starka prover (ct-värde <33) med minst 500 μL provmaterial.
Utvalda laboratorier
- Klinisk mikrobiologi, Laboratoriemedicin, Gävle sjukhus
- Klinisk mikrobiologi, Sahlgrenska Universitetssjukhus, Göteborg
- Klinisk mikrobiologi, Centralsjukhuset, Karlstad
- Klinisk mikrobiologi, Universitetssjukhuset, Linköping
- Klinisk mikrobiologi, Sunderby sjukhus, Luleå
- Klinisk mikrobiologi, Skånes Universitetssjukhus, Lund
- Klinisk mikrobiologi, Karolinska Universitetslaboratoriet, Solna
- Klinisk mikrobiologi, Norrlands Universitetssjukhus, Umeå
- Klinisk mikrobiologi, Östersunds sjukhus, Östersund
Metodik
För analys av prov genomförs molekylär påvisning och typning (PCR, sekvensering) samt virusisolering.
Sentinelprover från primärvården testas för SARS-CoV-2, RSV samt influensavirus, där influensapositiva prover också sub- och linjetypas.
Rapportering och analys
Förutom angivna intervall kan rapportering ske oftare om särskilda behov föreligger, exempelvis vid utbrott. Resultat finns tillgängliga via sjukdomsstatistik för respektive agens/sjukdom eller på utbrottssidan.