SARS-CoV-2 helgenomsekvensering (Sekvensering)
Genetisk karaktärisering av SARS-CoV-2 som orsakar covid-19.
- Indikation
 - 
        
Folkhälsomyndigheten tar emot SARS-CoV-2 PCR positiva prover för helgenomsekvensering vid specifika frågeställningar som kräver fördjupad analys.
 - Provmaterial
 - 
        
Främst prover från luftvägarna (nasofarynxsekret, näsprov, svalgprov, saliv, sputum, BAL och saliv) samt biopsimaterial och eluat från extraktioner.
 - Provtagningsanvisningar
 - 
        
Enligt det lokala laboratoriets anvisningar för respektive provmaterial.
Provmaterialet bör förvaras i kyl inför transport.
 - Transport
 - 
        
För praktisk handledning se Packa provet rätt.
För en snabb transport hänvisar vi exempelvis till PostNord expressbrev som levereras nästföljande vardag innan kl 10.
 - Svarstid
 - Upp till 3 månader beroende på frågeställning.
 - Ackrediterad
 - Nej
 - Anmälningspliktig enligt SML
 - 
        Ja 
Fynd av SARS-CoV-2 är anmälningspliktigt och anmäls av det laboratorium som utför primärdiagnostik.
 - Avgiftsbelagd
 - Nej
 - Övrig information
 - 
        
Transport av prov till Folkhälsomyndigheten för mikrobiologisk analys