Mikrobiellt övervakningsprogram för ESBL-CARBA Enterobacterales
ESBL-CARBA Enterobacterales ingår i vårt mikrobiella övervakningsprogram. Här finns kort information om programmets syfte, omfattning och metodik.
Syfte
Att karaktärisera alla nya fynd av ESBL-CARBA-producerande bakterieisolat i ordningen Enterobacterales i syfte att detektera nationella spridningar samt förändringar i resistensmekanismer och resistensmönster. ESBL-CARBA- producerande bakterier är ett allvarligt hot mot hälso- och sjukvård på grund av att få behandlingsalternativ finns tillgängliga och att det föreligger en betydande risk att bakterien är resistent mot alla tillgängliga antibiotika.
Omfattning
Alla konfirmerat positiva ESBL-CARBA producerande isolat inom ordningen Enterobacterales samlas in. Art och detekterat enzym/gen (ESBL-CARBA) ska framgå av remiss.
Observera att:
- Ett isolat från varje nytt fall ska alltid skickas in.
- Upprepade isolat från samma fall ska endast skickas in om de skiljer sig från det första isolatet med avseende på art och/eller ESBL-CARBA-enzym/gen.
Vid mycket stark misstanke på ny stam trots samma art och ESBL-CARBA-enzym/-gen, ska detta anges på remissen. Typning med helgenomsekvensering (WGS) kan då övervägas.
Kriterier för utredning av ESBL-CARBA hos Enterobacterales framgår av flödesschema i NordicAST brytpunktstabell.
NordicASTs breakpoint tables (nordicast.org)
Konfirmation av ESBL-CARBA kan utföras med genetisk påvisning (WGS/NAAT) alternativt med specifik enzympåvisning (till exempel immunkromatografisk lateral flow-test). Notera att specifik enzym/gen-påvisning bör kombineras med annan utredning enligt NordicASTs flödesschema för att minimera risken för ofullständig detektion av ESBL-CARBA-enzymer. Vid negativt test och fortsatt misstanke om karbapenemasproduktion, i enlighet med flödesschemat, bör isolatet skickas till laboratorium som kan utföra fortsatt utredning av ESBL-CARBA med kompletterande tester eller WGS.
Mot debitering enligt ordinarie taxa, bistår Folkhälsomyndigheten med helgenomsekvensering i utredningssyfte, där även icke-konfirmerade ESBL-CARBA isolat mottages för analys. Isolat som bedöms som ESBL-CARBA-producerande efter utredning debiteras ej.
Metodik
Helgenomsekvensering för detektion av resistensgener och sekvenstyp samt klusteranalys för upptäckt av eventuella släktskap. Resultaten kompletteras i efterhand med fenotypisk resistensbestämning för övervakningsändamål.
Rapportering och analys
Förutom angivna intervall kan rapportering ske oftare om särskilda behov föreligger, exempelvis vid utbrott. Resultat finns tillgängliga via sjukdomsstatistik för respektive agens/sjukdom eller på utbrottssidan.