Mikrobiellt övervakningsprogram för ESBL-CARBA Pseudomonas
ESBL-CARBA Pseudomonas ingår i vårt mikrobiella övervakningsprogram. Här finns kort information om programmets syfte, omfattning och metodik.
Syfte
Att karaktärisera alla nya fynd av ESBL-CARBA-producerande Pseudomonas spp. isolat i syfte att detektera nationella spridningar samt förändringar i resistens. ESBL-CARBA är ett allvarligt hot mot hälso- och sjukvård på grund av att få behandlingsalternativ finns tillgängliga och att det föreligger en betydande risk att bakterien är resistent mot alla tillgängliga antibiotika.
Omfattning
Alla konfirmerat positiva ESBL-CARBA producerande Pseudomonas-isolat samlas in, inklusive Klass B (till exempel NDM, VIM) och Klass A (till exempel KPC). Detekterat enzym/gen (ESBL-CARBA) ska framgå av remiss.
Observera att:
- Ett isolat från varje nytt fall ska alltid skickas in.
- Upprepade isolat från samma patient ska endast skickas in om de skiljer sig från det första isolatet med avseende på ESBL-CARBA-enzym/gen.
Kriterier för utredning av ESBL-CARBA hos Pseudomonas aeruginosa framgår av flödesschema i NordicAST brytpunktstabell.
NordicASTs breakpoint tables (nordicast.org)
Konfirmation av ESBL-CARBA kan utföras med genetisk påvisning (WGS/NAAT) alternativt med specifik enzympåvisning (till exempel immunkromatografisk lateral flow-test). Notera att specifik enzym/gen-påvisning för P. aeruginosa bör kombineras med annan utredning enligt NordicASTs flödesschema för att minimera risken för ofullständig detektion av ESBL-CARBA-enzymer. Vid negativt test och fortsatt misstanke om karbapenemasproduktion, i enlighet med flödesschemat, bör isolatet skickas till laboratorium som kan utföra fortsatt utredning av karbapenemasproduktion med kompletterande tester eller WGS.
För andra arter än P. aeruginosa finns inga rekommendationer för utredning. Om ESBL-CARBA-enzym/gen ändå skulle påvisas i annan art än P. aeruginosa omfattas dock även dessa isolat av övervakningsprogrammet.
Mot debitering enligt ordinarie taxa, bistår Folkhälsomyndigheten med helgenomsekvensering i utredningssyfte, där även icke-konfirmerade ESBL-CARBA isolat mottages för analys. Isolat som bedöms som ESBL-CARBA-producerande efter utredning debiteras ej.
Metodik
Helgenomsekvensering för detektion av resistensgener och sekvenstyp samt klusteranalys för upptäckt av eventuella släktskap. Resultaten kan kommas att kompletteras i efterhand med fenotypisk resistensbestämning för övervakningsändamål.
Rapportering och analys
Förutom angivna intervall kan rapportering ske oftare om särskilda behov föreligger, exempelvis vid utbrott. Resultat finns tillgängliga via sjukdomsstatistik för respektive agens/sjukdom eller på utbrottssidan.