Webbplatsen stödjer inte längre Internet Explorer

Folkhälsomyndigheten.se stödjer inte längre Internet Explorer.
För att du ska få den bästa användarupplevelsen rekommenderar vi dig att använda den senaste versionen av någon av de vanligaste webbläsarna (Microsoft Edge, Microsoft Edge Chromium, Google Chrome, Safari, Mozilla Firefox).
Vi har byggt webbplatsen i enlighet med gällande standarder, i stället för att anpassa den efter felaktigheter och brister i specifika webbläsare.

Instruktion till laboratorier för insändande av prover för sekvensering och typning av SARS-CoV-2

Sekvensering och genetisk typning av SARS-CoV-2 görs av Folkhälsomyndigheten vid specifika frågeställningar som kräver djupare sekvensanalys.

Ct 30 eller lägre (tillräckligt höga virusnivåer i provet) krävs normalt för att WGS ska utföras. Använd E-remiss. Det är viktigt att kryssa i frågeställning för sekvensering enligt definitionerna nedan samt att ange relevant tillgänglig klinisk information under ”Övrig information”.

E-remiss SARS-Cov-2 (covid 19) sekvensering eller typnings-PCR

Tabell: Information till remiss för SARS-CoV-2 sekvensering.
Frågeställning (kryssas i på e-remiss)	Beskrivning	Anamnes-uppgifter Anges i "övrig information"
Reinfektion	Två prover från samma patient med >3 månader mellan.	Insjuknandedatum och symtom samt information om vilka prover som skall analyseras tillsammans.
Utbrottsutredning/ Smittspårning	Detaljerad utredning av möjliga smittsamband. Oftast räcker ett begränsat antal prover från ett utbrott.	Utbrottsanalys utförs med SNP analys (single nucleotide polymorphism). Ange information om vilka prover som skall analyseras tillsammans.
Riktad insamling	Undersökning av utvalda prover.	Ange orsak till riktad insamling.